На территории заказника «Барбастелла» выявлены места обитания ряда видов животных, включенных в Красную книгу Республики Беларусь (2015). Среди них европейская широкоушка (Barbastella barbastellus Schreber) II категория, прудовая ночница (Myotis dasycneme Boie) II категория, северный кожанок (Eptesicus nilssoni Keyserling & Blasius) IV категория, ночница Наттерера (Myotis nattereri Kuhl) III категория, обыкновенная пустельга (Falco tinnunculus Linnaeus) III категория, коростель (Crex crex Linnaeus) III категория, большой кроншнеп (Numenius arquata Linnaeus,) II категория, большой веретенник (Limosa limosa Linnaeus) III категория, зеленый дятел (Picus viridis Linnaeus) III категория, белая лазоревка (Cyanistes cyanus Pallas) III категория. Из охраняемых видов растений отмечена камнеломка зернистая (Saxifraga granulata L.) III категория.