Лесами в заказнике покрыто более 80% площадей, в основном – сосновыми и еловыми. На территории заказника находится очень редкая для Беларуси формация липовых лесов, а также огромные дубы возрастом 250-300 лет.
Отмечена одна из крупнейших в Гродненской области колония серых цапель. Здесь выявлено 9 видов растений и 11 видов животных, занесенных в Красную книгу Республики Беларусь.
В далеком прошлом территория заказника была собственностью князей Радзивиллов, местом охоты магнатов и шляхтичей.
Заказник «Графская пуща» входит в состав ядра национального значения экологической сети Республики Беларусь «Налибокский» (N9), включающего также республиканские заказники «Налибокский» и «Миранка».