Имеет природоохранную ценность в первую очередь как один из немногих ландшафтных комплексов эоловых форм рельефа, которые сформировались в послеледниковое время.
В разнообразном растительном мире выделяются старовозрастные сосняки по вершинам и склонам древних дюн, березовые леса и черноольшаники.
Участки сфагновых верховых и переходных болот на территории заказника служат истоками лесных ручьев и поддержанию стабильного гидрологического режима этой уникальной природной территории. Луга по пойме реки Вилия – место многих южных видов растений.
В заказнике разнообразный животный мир, однако охота запрещена.